Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms