Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprsB0V2N1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms