Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms