Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms