Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms