Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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