Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms