Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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