Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prg4Q9JM99 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prg4Q9JM99 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prg4Q9JM99 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prg4Q9JM99 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prg4Q9JM99 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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