Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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