Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms