Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl28Q9JIL2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl28Q9JIL2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl28Q9JIL2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl28Q9JIL2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl28Q9JIL2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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