Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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