Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hmgn3Q9DCB1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hmgn3Q9DCB1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hmgn3Q9DCB1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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