Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hmg20aQ9DC33 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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