Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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