Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrn2Q9DBR1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms