Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pop5Q9DB28 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pop5Q9DB28 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pop5Q9DB28 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pop5Q9DB28 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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