Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms