Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Chmp5Q9D7S9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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