Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms