Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms