Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms