Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms