Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms