Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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