Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tdrd12Q9CWU0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Tdrd12Q9CWU0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tdrd12Q9CWU0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tdrd12Q9CWU0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tdrd12Q9CWU0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms