Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms