Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms