Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Mrpl20Q9CQL4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Mrpl20Q9CQL4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Mrpl20Q9CQL4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Mrpl20Q9CQL4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mrpl20Q9CQL4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms