Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms