Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms