Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup155Q99P88 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms