Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RetnQ99P87 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms