Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nuf2Q99P69 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms