Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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