Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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