Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Snx15Q91WE1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx15Q91WE1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms