Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Klc3Q91W40 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms