Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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