Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms