Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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