Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pnma3Q8JZW8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pnma3Q8JZW8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pnma3Q8JZW8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pnma3Q8JZW8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pnma3Q8JZW8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pnma3Q8JZW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms