Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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SbsnQ8CIT9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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SbsnQ8CIT9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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SbsnQ8CIT9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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