Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Arhgap29Q8CGF1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms