Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Brf1Q8CFK2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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