Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms