Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms