Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4aQ8BW72 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Kdm4aQ8BW72 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Kdm4aQ8BW72 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms