Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms